Трајко Ѓотов е роден во 1870 година во селото Драгомирци (денес Пеонија), Кукушко.
По приклучувањето кон ВМОРО најпрво бил четник во четите на Васил Килифарски и Георги Тотев. Со својата храброст и посветеност кон револуционерното дело се истакнал меѓу борците, по што станал војвода на сопствена чета во Кукушко.
За време на Илинденското востание во 1903 година активно учествувал во борбите во Кукушко и Гевгелиско. Особено се истакнал во судирите кај селата Аматово и Постолар.
На 13 октомври 1903 година, заедно со четите на Апостол војвода и Иван Карасулијата, водел голема борба против османлиските сили. Во таа борба востаниците успеале да ги поразат пешадиските и коњаничките единици собрани од Гевгелија, Ениџе Вардар и Гуменџе, нанесувајќи им значителни загуби.
По востанието продолжил да остане активен во револуционерното движење и во одбраната на македонското население.
Во 1912 година, за време на Првата балканска војна, учествувал со своја чета како дел од силите што му давале поддршка на Македонско-одринскиот доброволен корпус, предводен од Тодор Александров.
Трајко Ѓотов починал во 1941 година.
Тој останува запаметен како кукушки војвода и долгогодишен борец на македонското револуционерно движење, кој учествувал во Илинденското востание и во понатамошните борби за слободата на Македонија.