Јане Сандански е роден на 18 мај 1872 година во селото Влахи, Мелничко (денешно Санданско). Завршил основно образование и втори клас гимназија. Потоа две години го изучувал чевларскиот занает како чирак. Работел како молбописец и помошник адвокат во адвокатската канцеларија на својот вујко, а подоцна и самостојно.
Во Македонската револуционерна организација (МРО) стапил во 1899 година, по неговото запознавање со Гоце Делчев. Во Пиринскиот крај формирал своја чета со која активно дејствувал и станал еден од најистакнатите и најнепомирливи борци против врховизмот.
Заедно со војводите Христо Чернопеев и Крсто Асенов, во август 1901 година го организирал грабнувањето на американската протестантска мисионерка Мис Елен Стоун. По нејзиното ослободување бил исплатен откуп од 14.000 турски златни лири, средства кои биле искористени за потребите на револуционерната борба.
По загинувањето на Гоце Делчев во 1903 година, Јане Сандански станал еден од главните раководители на Серскиот револуционерен округ. За време на Младотурскиот режим (1908–1912) се наоѓал на чело на Народната федеративна партија, основана во Солун.
Во текот на Првата балканска војна зел активно учество на страната на сојузниците, предводејќи поголем доброволечки одред.
Јане Сандански бил убиен на 21 април 1915 година кај местото Папаз Чаир, на Пирин Планина, од агенти на бугарскиот цар Фердинанд. Со својата револуционерна дејност, организациски способности и борба за слободата на Македонија, тој останува една од најзначајните личности во историјата на македонското револуционерно движење.